Вы все равно не достигнете эффекта пластикового окна ремонтируя старое деревянное, поэтому если средства позволяют установите новое окно, если нет, то вариант с силиконом в принципе неплохой. Незабудьте и штапики посадить на силикон для герметичности. Все будет лучше чем то что вы имеете сейчас.