Если изменению подвергнутся не несущие стены, то можете. Только заблаговременно сообщите об этом строителей. Однако, если вы не являетесь специалистом в этой области, то за помощью лучше все же обратиться к грамотному архитектору. Кстати, если этот готовый проект вы еще не приобрели, а только его «присмотрели», то перепланировку можно заказать прямо у тех, кто продает этот проект. Конечно, если это не частник-перекупщик, а серьезная организация.