Для этого канализация, например, при замене труб, устанавливается стандартного диаметра, без выдумок. Это для начала. Потом не бросается туда все что было под рукой лишнего, а если есть мнение, что бросается, то можно установить фильтры или решетки. Также на каждый слив в ванной и раковине на кухне установите сеточки, которые будут предотвращать попадание лишнего мусора в систему.