Вообще как-то странно, что из-за гидроизоляции пошли трещины по фундаменту. Скорее всего это усадочные деформации в результате чего трещит фундамент и нарушилась гидроизоляция. Это следствие некачественного уплотнения грунта под фундамент или недостаточная глубина его заложения.