Вполне достаточно будет пройтись по вагонке шлифмашинкой с очень тонкой шлифшкуркой. Максимум 80, а лучше 100. Потемневший слой не должен быть сильно въевшимся, поэтому легко снимется до древесины естественного цвета. А дальше бесцветной пропиткой, желательно на масляной основе и ваонка будет радовать вас не один год.