Гвозди или саморезы в досках можно утопить, а шляпки задекорировать специальным декоративным воском для древесины, или зашпатлевать. Потом, многое зависит от того, какие доски вы будете использовать для полов - шпунтованные или обычные. И кстати, гвозди прибитые легко закрыть широким плинтусом по периметру беседки.