На самом деле, большого смысла в гидроизоляции в данном случае нет, поскольку по Вашим словам чердак и-так вентилируемый, и если правильно будет установлена кровля из металлочерепицы, то ничего не грозит ни стропилам, ни обрешетке. Но вот сделать на всякий случай гидроизоляцию полов на чердаке и утеплить эти полы я бы Вам рекомендовал.