К главным недостаткам кровли из шифера относится то, что он изготовлен из асбеста, что негативно влияет на здоровье человека, особенно, если шифером покрыта жилая мансардная кровля. Со временем шифер покрывается мхом. Шифер имеет большой вес, что подразумевает усиленные стропила и стропильные балки. Его не используют на кровлях свыше 45 градусов наклона, очень хрупок - ломается часто при транспортировке и монтаже.