Похоже, что у вас не была произведена правильная гидро- и пароизоляция кровельной системы. Вам необходимо полностью демонтировать всю обшивку. Теперь она годится разве что на дрова. Необходимо тчательно зачистить стропильные балки, удалив загнившие участки и плесень. Тщательно просушить стропильные ноги с помощью строительного фена, да и в мансарде усилить тепловентиляцию мощным строительным ветерком. После просушки, дважды обработайте стропила противогрибковым раствором. Трещины заделайте шпатлевкой. Если они большие, шпатлевку смешивают с мелким гравием или крупным песком. После высыхания, прогрунтуйте поверхность.