Давайте попробуем мыслить логично. Мы имеем крышу прямо над головой, правильно смонтированные и установленные окна, отремонтированый гидроизолирующий слой на крыше и при этом имеем грибок на окнах, который возникает только в одном случае - влага. Особое внимание привлекает факт, грибок - не над дверью, не в середине потолка, не по какой нибудь внутренней межкомнатной стене, а именно на окнах. Учитывая внимательность того самого, молодого сотрудника обнаружевшего ОДНУ ИЗ ПРИЧИН образования грибка, можно предположить, что существуют ЕЩЕ ПРИЧИНЫ. Теперь пофантазируем. Для того, что бы вода попала на окно, она должна сначала попасть под рубероид на крыше и стечь по стене, возможно по внутренней ее стороне, через щель между плитами - к окнам. Участок над квартирой отремонтировали, но почему сделали вывод, что вода попадает под рубероид, именно в этом месте? тем более практика показывает, что фрагментальный ремонт гидроизоляции крыши не дает никакого результата.