Толщина слоя зависит от конкретного вида клея и плитки. Если вы уверены в том что неровности значительны и они заметны, то для их выравнивания в этом случае необходимо использовать клей, технические характеристики которого позволяют укладывать его как тонким, так и толстым слоем. Также не забывайте о самой плитке - от размеров плитки зависит расход клеящей массы.