Скорее всего, у вас действительно глинистая или суглинистая почва. Для более быстрого оттока воды в нее необходимо добавить песок. А чтобы вода после дождей не стояла лужей в вашем цветнике, попробуйте по весне подсыпать земли, создав небольшой холмик, закрепив несколькими крупными камнями или валунами. Проследите, чтобы на цветник не стекала вода с крыши или с другого места.