Вообще то для кустарников - это даже полезно, в частности, для смородины и малины. Они дают боковые побеги, молодые, и время от времени их даже рекомендуют подсыпать торфом или перегноем.
А что касается остальных насаждений - выберите время, когда на этом участке их останется максимально мало (поздней осень, например). Не забудьте про луковичные и клубневые цветы. Их можно слишком сильно засыпать и они весной не смогут пробиться сквозь эту толщу.