Главное соблюсти все технические условия при строительстве дымохода, как вам правильно сказали выше и высоту, и кстати, расположение по отношению к коньку крыши тоже важно иначе может просто задуваться образующимися завихрениями, и про чистить хорошо напомнили. Обратитесь к спецу, пусть он вам спроектирует дымоход - и все будет нормально.