ну в общем-то каких-то особенных правил при проектировании деревянного дома нет (по сранению с другими видами домов), просто вам надо учитывать такую вещь, как усадка дома. Как известно, деревянные дома склонны давать усадку (наиболее сильно в первый год после строительства) ну и во второй год тоже немного. Так что при проекте учитывайте ещё и это! Также всё сильно зависит от того, из какого конкретно материала вы будете строить ваш дом (из бревен, из бруса, или вообще выберете каркасный домик), там тоже свои есть особенности у каждого из домов! Главное не забудьте про проект фундамента и про отдельный проект крыши!