да, смешивать вместе в одну постройку и курятник и утятник неправильно, куры должны находиться отдельно а утки тоже отдельно. Просто это и с точки зрения заболеваний различных важно и с точки зрения здоровья, чтобы инфекции разные не переносились и с точки зрения популяции)))) так что это надо либо два отдельных здания делать, либо строить одно помещение для них и его разделить перегородкой, так будет проще конечно, только перегородка должна быть прочной и чтобы они ее не расклевали.
а вообще это отличная идея, я бы тоже обзавелся домашней живностью,экологически чистой кстати))))))