Для стратификации ("переслаивания") используют субстрат, т. е. материал, в котором будут находиться семена в период стратификации. Для семечковых - это хорошо промытый крупный речной песок или мелкие древесные опилки, предварительно просеянные. Их смешивают с семенами из расчета 3 части субстрата и 1 часть семян (по объему) и хорошо увлажняют. Температура хранения семян в это время - плюс 3-5°С, при появлении первых проклюнувшихся семян ее понижают до 0-минус 1°С (для семечковых пород это делают за 30-40 дней до высева семян).
Для косточковых культур можно использовать тот же субстрат. А можно использовать мох. Семена косточковых нельзя пересушивать, поэтому после извлечения из плодов их сразу помещают во влажную среду. После извлечения из плодов косточки смешивают с песком в пропорции 1:4 и, переслаивая мхом, помещают в глиняный горшок. Субстрат увлажняют, горшок помещают в тень, лучше с северной стороны дома, где он находится в таком состоянии до первых заморозков. С их наступлением в самой высокой точке сада выкапывают небольшую ямку глубиной примерно 40 см, на дно этой ямки ставят горшок, который сверху накрывают глиняной тарелкой дном вверх (так, чтобы в горшок не попадала излишняя влага), после чего все засыпают вынутой из ямы почвой вровень с поверхностью. В таком состоянии горшок оставляют до весны. Ко времени посева у большинства косточек оболочка треснет и будут видны ростки.