Я тоже считаю, что от вагонки (честно говоря не очень поняла из поста из какого материала будет вагонка) в любом случае особого вреда нет. Не делайте ее только непосредственно над плитой - тогда все будет в порядке. Пространство над плитой лучше отделать материалом понадежнее в плане тепло- и жиро- устойчивости.